nanacoのチャージでポイントが付与されるクレジットカードは、それほど多くはありません。
その中で貯まったポイントの使い勝手、一般利用の還元率、年会費の有無などから総合すると、楽天カード（JCB）、Yahoo! Japan カード(JCB)、または、リクルートカードが、最も適しているかと思われます。

※2015年から、漢方スタイルクラブカードは、nanacoへのチャージで、還元率が1.75%→0.25%になります。今後も、電子マネーへのチャージでは、ポイント還元は、なくなる方向だと考えられます。
※2017年11月から、楽天カード(JCB)を利用したnanacoチャージには、ポイントがつかなくなりました。
※2018年2月28日15時から、Yahoo! Japan カード(JCB) でのnanacoチャージの還元率が改悪になりました。
これまで100円につき1ポイント(1%)だったものが、200円について1ポイント(0.5%)となります。

現時点でポイントが付与されるカード（主なものを抜粋）

・リクルートカード(VISA)
　→ VISA、JCBどちらもチャージでポイントがつきますが、汎用性を考えるとVISAブランドがおススメ。
　ポイントの利用法に課題がありますが、年会費無料で高還元（1.2%）。
　ただし、月30,000円までの制限がついています。

・Yahoo! Japan カード
　2018年2月28日15時以降、Yahoo! Japan カード(JCB)を利用したnanacoチャージのポイント付与率が0.5%(200円につき1ポイント)になりました。
　ポイントがつかないよりはマシですが、やはり改悪は残念ですね。

・楽天カード（JCB）
　→ ポイントがつくのは、JCBブランドのみ。
　2017年11月より、ポイントがつかなくなりました。

【その他】
nanacoチャージが可能なクレジットカードには、セブンカード・プラスがあります。
ただし、還元率は0.5%。
たまるポイントもnanacoポイントですので、他のポイントへの集約ができず、nanaco へのチャージにしか実質使えません。
年間5万円以上の利用で年会費無料となりますが、一般利用での還元率も0.5%。
高還元カードとは言えず、おススメカードにはなりません。
セブン&アイグループで、ポイント2倍3倍のキャンペーンなどもありますので、生活範囲を考えれば、選択肢に入るかもしれません。